Chromatin Dynamics and Metabolism in Cancer

Nous nous intéressons aux premiers stades de l'oncogenèse dans le but de trouver des biomarqueurs précoces du cancer et d'identifier de nouvelles approches de prévention et de traitement. Les infections virales déclenchent des changements majeurs dans l'organisation du noyau, les profils de transcription et la régulation de la voie mTORC1 dans les cellules infectées. Nous étudions comment les virus et leurs protéines déclenchent le cancer et comment ils affectent la stabilité du génome, modulent l'organisation nucléaire et le métabolisme. Nous analysons les changements liés au cancer dans la transcription des gènes et l'organisation du génome au niveau d'une seule cellule, et cherchons les biomarqueurs précoces du cancer des lymphomes. Enfin, nous nous intéressons à une meilleure compréhension des mécanismes impliqués dans la résistance aux médicaments acquise par les lymphomes des cellules B et nous développons de nouveaux outils pour surmonter cette résistance.

Lab Memebers

  • Svetlana Dokudovskaya, DR2 CNR
  • Yegor Vassetzky, DR1 CNRS
  • Joëlle Wiels, DREM CNRS
  • Marc Lipinski, DREM CNRS
  • Julien Lazarovici, Hematologist, Gustave Roussy
  • Diego Germini  - Postdoc
  • Burkitkan Akbay  - PhD student
  • Reynand Jay Canoy  - PhD student
  • Fatimata Bintou Sall   - PhD student
  • Yahir Alberto Loissel Baltazar – PhD student
  • Anna Shmakova - PhD student
  • Anna Karpukhina - Master student

Publications récentes

  • Germini, D., Sall, F.B., Shmakova, A. A., Wiels, J., Dokudovskaya, S., Drouet, E. and VASSETZKY, Y.S. (2020) Oncogenic properties of the EBV ZEBRA protein. Cancers DOI:10.3390/cancers12061479  IF=6.1
  • Sorokin, D.V., Arifulin, E.A., Vassetzky, Y.S. and Sheval, E.V. (2020) Live-cell imaging and analysis of the mobility of nuclear bodies. Methods Mol. Biol. DOI: 10.1007/978-1-0716-0763-3
  • Akbay, B., Shmakova, A., Vassetzky, Y.S. and Dokudovskaya, S. (2020) Modulation of mTORC1 signaling pathway by HIV-1, Cells, cells-769158 in press IF=5.6
  • Saleh, K., Michot, J.-M., Camara-Clayette, V., Vassetzky, Y., Ribrag, V. (2020) Burkitt and Burkitt-like lymphomas: a systematic review. Curr. Oncol. Rep. 22:33 DOI: 10.1007/s11912-020-0898-8 IF=3.9
  • Karpukhina, A. and Vassetzky, Y.S. (2020) DUX4, a zygotic genome activator, is involved in oncogenesis and genetic diseases. Ontogenez, DOI: 10.31857/S0475145020030076
  • Ribrag, V., Camara-Clayette, V., Bosq, J., Dartigues, P. Vassetzky, Y. (2020) Burkitt Lymphoma. EMC Hematologie, 31:1-13 DOI:10.1016/S1155-1984(19)83317-4
  • Iarovaia, O.V., Minina, E.P., Sheval, E.V., Dokudovskaya, S.S., Razin, S.V. and Vassetzky, Y.S. (2019) Nucleolus: organizing the functioning of the genome. Trends in Cell Biology, DOI: 10.1016/j.tcb.2019.04.003, IF=18.5
  • Shmakova, A., Germini, D. and Vassetzky, Y.S. HIV-1, HAART and cancer: a complex relationship. Int. J. Cancer, DOI:10.1002/IJC.32730, IF=7.4
  • Dib, C., Zakharova V.V., Popova, E., Kiseleva E.V., Chernyak, B.V., Lipinski M., and Vassetzky, Y.S. (2019) DUX4 pathological expression: causes and consequences in cancer. Trends in Cancer, 5:268-271 DOI: 10.1016/j.trecan.2019.03.001 IF=5.1
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  • Debernardi J, Hollville E, Lipinski M, Wiels J, Robert A. (2018) Differential role of FL-BID and t-BID during verotoxin-1-induced apoptosis in Burkitt's lymphoma cells. Oncogene. 7:2410-2421. doi: 10.1038/s41388-018-0123-5. IF=6.8
  • El-Amine, R., Germini, D., Zakharova V.V., Tsfasman, T., Sheval, E.V., Louzada, R.A.N., Dupuy, C., Hamade, A., Najjar, F., Bilhou-Nabera, C., Oksenhendler, E., Lipinski M., Chernyak, B.V. and Vassetzky, Y.S. (2018) HIV-1-Tat protein induces DNA damage in human peripheral blood B-lymphocytes via mitochondrial ROS production. Redox Biology, 15:97-108 DOI: 10.​1016/​j.​redox.​2017.​11.​024 IF=7.1
  • Germini, D., Tsfasman, T., Klibi M., Pichugin, A., El-Amine, R.,  Iarovaia, O., Bilhou-Nabera, C., Subra, F., Bou Saada, Y., Sukhanova, A., Boutboul, D., Raphaël, M.,  Wiels, J, Razin, S., Bury-Moné, S., Oksenhendler, E., Lipinski M., and Vassetzky, Y.S. (2017) The HIV-1 Tat protein induces MYC  relocalization next to IGH in normal B-cells. Leukemia, 31:2515-2522 DOI: 10.1038/leu.2017.10 IF=11.7
  • Germini, D., Bou Saada, Y., Osina, K., Tsfasman, T., Robin, C., Sjakste, N., Lipinski M., and Vassetzky, Y.S. (2017) A one-step PCR-based assay to evaluate efficiency and precision of genomic DNA-editing tools. Mol. Therapy, 2017 5:43-50 DOI: 10.1016/j.omtm.2017.03.001 IF=6.7
  • Pichugin A.,  Iarovaia O.V., Gavrilov, A.,Sklyar, I., Barinova, N.,  Barinov, A.,  Ivashkin, E.,  Caron, G., Aofouchi, S., Razin, S.V., Fest, T., Lipinski M. and Vassetzky, Y.S. (2017) The IGH locus relocalizes to a “recombination compartment” in the perinucleolar region of differentiating B-lymphocytes. Oncotarget, 8:40079-40089 DOI:10.18632/oncotarget.16941 IF=6.4
  • Musinova, Y.R., Lisitsyna, O., Sorokin, D., Arifulin, E. Smirnova, T., Potashnikova, D., Vassetzky, Y.S. and Sheval, E.V. (2016) RNA-dependent dynamic assembly of nucleoli and nuclear bodies. J Cell. Sci., 129:4509-4520 DOI:10.1242/jcs.189142 IF=5.4
  • Allinne J., Pichugin A.,  Iarovaia O.,  Klibi M., Barat A., Zlotek-Zlotkiewicz E., Markozashvili1 D., Petrova N.,  Camara-Clayette V.,  Ioudinkova E., Wiels, J, Razin, S., Ribrag V., Lipinski M. and Vassetzky, Y.S. (2014) Perinucleolar relocalization and nucleolin as crucial events in the transcriptional activation of key genes in mantle cell lymphoma. Blood. 123:2044-53 DOI:10.1182/blood-2013-06-510511 IF=15.5

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